ผักบุ้งนาเป็นไม้ล้มลุกหลายปี ลำต้นเลื้อยทอดไปตามน้ำหรือที่ลุ่มที่มีความชื้น หรือดินแฉะ ลำต้น กลมสีเขียว สีเขียวอมแดง มีข้อปล้องและมีรากตามข้อปล้องส่วนที่สัมผัสกับดิน 

ใบ ใบเดี่ยวออกแบบสลับ รูปไข่แกมขอบขนาน รูปหอก รูปหัวลูกศร ขอบใบเรียบ หรือมีควั่นเล็กน้อย ปลายใบแหลมหรือมน ฐานใบรูปหัวใจ ใบยาว 3-15 เซนติเมตร กว้าง 1-9 เซนติเมตร 

ดอก รูประฆัง ออกเป็นช่อที่ซอกใบ มีดอกย่อย 1-5 ดอก กลีบเลี้ยงสีเขียว กลีบดอกพบทั้งสีขาวหรือชมพูที่ฐาน เกสรเพศผู้มี 5 อัน ยาวไม่เท่ากัน 

ผล รูปไข่หรือกลมสีน้ำตาลมีเมล็ดกลมสีดำ